Digitální mikroskopy se stále více používají ve vědě, protože jsou cenově dostupné a snadno se používají. Vědci používají digitální mikroskopy pro sběr a archivaci vědeckých dat. Profesionálové používají digitální mikroskopy k vytváření falešných obrazů, aby se studenti naučili vyhýbat se nebezpečí.
Digitální mikroskopy jsou dostupnější než tradiční mikroskopy a běžní lidé je používají častěji. Vědci je také snadno používají. Tyto mikroskopy mají totiž vyšší kvalitu obrazu a zvětšovací čočku. Obvykle je používají profesionálové ve výzkumu a vzdělávání, ale také je používají fandové k podrobnému prohlížení objektů. Digitální mikroskopy jsou velmi užitečné při sběru dat.